El sistema de gobierno de los EAU indica que el presidente de la Federación es elegido por un organismo conocido como el Consejo Supremo de Gobernantes. El Consejo Supremo es el principal órgano normativo para la formulación de políticas en EAU, y tanto el presidente como el vicepresidente son elegidos de sus miembros por períodos renovables de cinco años.
El Consejo Supremo tiene poderes legislativos y ejecutivos. Además de planificar y ratificar las leyes federales, el Consejo Supremo aprueba el nombramiento del primer ministro designado por el presidente y se reúne para aprobar su renuncia, si es necesario.
El primer ministro es nombrado por el presidente. Luego, el primero nombra un Consejo de Ministros, o un Gabinete, para supervisar el desarrollo y la implementación de la política federal en todas las carteras de gobierno.
Además del Consejo Supremo y el Consejo de Ministros, hay un parlamento de 40 miembros conocido como el Consejo Nacional Federal (FNC, por sus siglas en inglés) cuya función es proponer nuevas legislaciones y proporcionar asesoramiento al gabinete de los EAU, según sea necesario. El FNC está facultado a mocionar e interrogar a los ministros con respecto a su propio desempeño, proporcionando un grado adicional de responsabilidad al sistema. En diciembre de 2006 se realizaron avances revolucionaros, para hacer el proceso de toma de decisiones aún más riguroso, con las primeras elecciones indirectas de los miembros del FNC. Anteriormente, todos los miembros de del FNC eran nombrados por los gobernantes de cada Emirato.
La introducción de las elecciones indirectas representa el comienzo de un proceso de modernización del sistema de gobierno de los EAU. Bajo estas reformas, los gobernantes individuales seleccionan un colegio electoral cuyos miembros suman 100 veces el número de los miembros del FNC en poder de ese Emirato. Entonces, los miembros de cada colegio eligen a la mitad de los miembros del FNC, mientras que la otra mitad sigue siendo nombrada por cada gobernante.
Las elecciones más recientes ocurrieron en 2015 llevaron a formar un FNC en el que casi una cuarta parte de sus miembros son mujeres, incluida la presidenta, la Dra. Amal Al Qubaisi. Las mujeres, también, sirven en el gabinete federal y son nombradas para cargos en el poder judicial.
Se espera que las iniciativas futuras amplíen el tamaño del FNC y fortalezcan la interacción entre este órgano y el Consejo de Ministros con el fin de mejorar aún más la eficiencia, la responsabilidad y la naturaleza participativa del gobierno en los EAU. En noviembre de 2008, el periodo de mandato de los miembros del FNC se amplió de dos a cuatro años, en coherencia con los otros parlamentos de todo el mundo. Además, el gobierno informa al FNC sobre los propuestos tratados y acuerdos internacionales, los cuales serán discutidos en el FNC antes de su ratificación.
Históricamente, el entorno político de los EAU se ha caracterizado por un gran afecto hacia los líderes del país y las instituciones de gobierno. Esto se debe, en gran parte, al rápido crecimiento y desarrollo que los EAU ha experimentado bajo su mandato durante las últimas décadas.
